1、故事前言 简述《序》 ...
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<剧场序>
由于史上空前的大灾难“第二次冲击”突然发生，因而造成人类近半数死亡，世界各地都留下了严重破坏的痕迹。经过一段长时间的修养生息之后，大家都认为平静的日子即将恢复，然而危机却并没有就此结束。
作为本故事主人公的14岁少年——碇真嗣，被父亲叫到了第3新东京市与其会面。而同时，在他所处街道旁的山林间突然出现了危险的巨大生物！那是被称为“使徒”的神秘存在。
不久，联合国军队随即与使徒展开激烈交战，一旁的真嗣遭到剧烈战斗的波及，面临生死存亡的威胁，最后幸运地被一位名叫“葛城美里”的女子所救。
真嗣搭乘美里的汽车来到了特务机关NERV本部，并在这里与相隔10年未曾见面的父亲重逢。然而真嗣的父亲．碇源堂所做的第一件事，却是强迫真嗣驾驶秘密研发的巨大人型兵器——EVA，让他前去与那危险的使徒战斗。这就是真嗣和人造人福音战士“初号机”的第一次邂逅。
真嗣虽然不愿从命，但他也不忍让身负重伤的第一适格者凌波丽代替自己战斗，于是他放弃逃避的念头，决定出击。
在完全没有接受训练的状况下，首次驾驶EVA初号机的真嗣与使徒陷入对峙…
背负着全世界命运的14岁少年真嗣，他究竟要如何战斗？而隐藏在第二次冲击中的关键字“人类补完计划”究竟又是什么？
掌握一切谜题关键的碇源堂，在一旁冷眼旁观真嗣的苦战…
<剧场破>
在经过一系列与使徒的战斗后，少年真嗣已习惯了自己特殊的身份，并与同为EVA驾驶员的凌波丽建立起羁绊，但却仍然与父亲碇源渡的关系僵硬。
随后，真嗣与EVA二号机驾驶员明日香相识，两人一起同居于指挥官葛城美里家中，真嗣每天都为美里和明日香做早餐和便当，并细心关照凌波丽，他的生活因此变得融洽于祥和之中。而他的父亲碇源渡则是从间谍加持良治那里得到了神秘的“钥匙”，其作用仍不得而知。
之后，EVA三号机到来，明日香为了让凌波丽成功撮合真嗣与父亲的关系，自愿挺身替她测试三号机的启动试验，却不料三号机已被使徒寄生，明日香不幸遇难。
面对已经成为敌人的三号机，真嗣驾驶初号机却不敢贸然出手攻击，因为EVA与驾驶员的神经系统相连，真嗣害怕伤害到其中的明日香，所以他宁愿选择自己被三号机蹂躏，也不愿驾驶初号机进行反抗。
然而真嗣的父亲并不想看到这样的局面，他断开真嗣与初号机的链接，用傀儡系统操纵初号机将三号机撕成碎片。目睹一切的真嗣对父亲恨之入骨，决心驾驶初号机摧毁NERV，结果被碇源渡制服并陷入昏迷。
醒来的真嗣在冷酷的父亲面前宣言退出NERV，决定从此不再驾驶EVA。而就在他离开的同时，最强的使徒来袭，其恐怖的战斗力不仅打败了强势的二号机备用驾驶员真希波，还将凌波丽所驾驶的零号机吞入腹中。
见到如此情形的碇真嗣毅然决定返回NERV驾驶初号机扭转局面，可初号机却在战斗的关键时刻用尽能源，陷入危险。为了救被困于使徒体内的凌波丽，初号机在真嗣的“把绫波......还给我！”这句话之下觉醒，他从使徒身体中救出绫波后，EVA拘束具逐渐脱落。
“初号机将成为类似神的新生命，以新生命的诞生作为代价，第三次冲击即将开始，世界即将结束。” NERV技术主管的赤木律子在看到初号机的异常状态后发表了末日宣言。
六号机及时出现，并掷出卡西乌斯之枪击穿初号机的胸甲，致使第三次冲击因此停止并消失。
渚薰驾驶着六号机从天而降，并道出谜样话语：
“那么...约定的时刻来临了，碇真嗣君…至少这次一定完成你的幸福！”
作者有话说
第1章 故事前言
